戰隊司令官||||*（少将）
副官|||(少佐)
副官||（中尉）
　　　　司令官端舟長（一等信號兵曹）
　　　　端舟次長（二等信號兵曹）
先任参謀|||（中佐）
戰務参謀||（大尉）
航海参謀*||||（航海少監）
通信参謀*|||（大航海士）
　　暗號士（上等信號兵曹）
　　　　　　通信員（潜水母艦通信部員兼務）
船匠長（潜水母艦船匠長兼務）
機關長（潜水母艦機關長兼務）
軍醫長（潜水母艦軍醫長兼務）
主計長（潜水母艦主計長兼務）
　　掌經理長（潜水母艦掌經理長兼務）
司祭兼通譯官||||・（司祭：少佐相當乗組文官）
　　　　從者兼通譯（下士相當軍属）
司令官秘書|||・（秘書：大尉相當乗組文官）
　　　　書記４（筆記４）
　　　　　　助手（筆生５、使丁）
司令官室
　　　　上等廚宰
　　　　　　主廚、廚夫、從僕、給仕
士官室（士官３、特務士官３、乗組文官２）
　　　　廚宰
　　　　　　廚夫、從僕８、給仕
士官次室（士官１、准士官１）
　　　　廚宰
　　　　　　廚夫、從僕、給仕

射撃指揮所　高射射撃装置（4.5m測距儀・高射装置射撃盤）
砲術長・分隊長||（大尉）砲術指揮官
　　　　砲術長傳令*（乗組生徒）
　　　　　　眼鏡照準手（水兵４）
　　　　　　測距手（水兵）
　　　　　　等分距離發信手（水兵）

艦橋
航海長・分隊長*|||（大航海士）航海指揮官、見張指揮官、信號指揮官
　　　　航海長傳令*（乗組生徒）
航海長附・分隊士*|||（中航海士）氣象班指揮官
　　　　　　艦位測定補助員（信號兵）艦位測定・記入補助、作戰記録圖作成補助、氣象作業補助
　　　　　　氣象員兼記録員（信號兵）氣象作業、当直記録・作戰諸記録等記註

發着指揮所　飛行機射出器
飛行長・分隊長*|||（航空大尉）飛行指揮官・發着指揮官
　　　　射出器員長（一等兵曹）
　　　　　　射出手・装藥手・信號手（水兵２、信號兵）

船匠長・濳水長・分隊長*|||（大船匠）濳水指揮官・注排水指揮官、第２應急班指揮官（後部）、潜水戰隊船匠長兼務
　　掌船匠長・分隊士*|（上等船匠手）濳水工作用應急材料・要具の救急整備保管、他科兵の應急訓練

機關科指揮所
機關長・分隊長*||||（機關少監）運轉指揮官、潜水戰隊機關長兼務
　　　　機關長傳令（一等機關工手）
機關科當直士官（機關科士官兼務）
機關科副直士官（機關科士官・准士官兼務）
　　　　機關科特務下士２（先任一等機關工手兼務）
　　掌機長*|（上等機關工手）

　　　　　　要具庫員（一等機關工）

治療室
軍醫長・分隊長||||（軍醫少監）潜水戰隊軍醫長兼務
軍醫・分隊士|||（中軍醫）
齒科醫||・（少軍醫相當乗組文官）
　　　　看護長（一等看護手）
　　　　看護員長（二等看護手）
　　　　三等看護手
病室
　　　　　　看護員（看病夫４）
散髪所
　　　　　　剃夫３（卒待遇軍属）

主計長・分隊長|||（大主計）潜水戰隊主計長兼務

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